Protein–RNA interactions for Protein: Q0P521

1700013D24Rik, MCG1037134, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700013D24RikQ0P521 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
1700013D24RikQ0P521 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700013D24RikQ0P521 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700013D24RikQ0P521 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700013D24RikQ0P521 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700013D24RikQ0P521 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms