Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q08AU9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q08AU9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q08AU9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q08AU9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q08AU9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q08AU9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q08AU9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q08AU9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q08AU9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q08AU9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126 ms