Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn3Q07409 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn3Q07409 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms