Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp2Q06649 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms