Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Thbs2Q03350 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms