Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Muc1Q02496 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Muc1Q02496 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms