Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snai1Q02085 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snai1Q02085 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms