Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb2Q00977 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb2Q00977 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms