Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp1Q00915 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbp1Q00915 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms