Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Serpina1cQ00896 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serpina1cQ00896 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serpina1cQ00896 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Serpina1cQ00896 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Serpina1cQ00896 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Serpina1cQ00896 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Serpina1cQ00896 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms