Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa1Q00623 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa1Q00623 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms