Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smn1P97801 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smn1P97801 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smn1P97801 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms