Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfc1P97766 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfc1P97766 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms