Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccl21cP86793 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccl21cP86793 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccl21cP86793 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ccl21cP86793 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21cP86793 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ccl21cP86793 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ccl21cP86793 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccl21cP86793 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccl21cP86793 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ccl21cP86793 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21cP86793 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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