Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chl1P70232 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chl1P70232 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chl1P70232 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms