Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DccP70211 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DccP70211 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DccP70211 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DccP70211 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DccP70211 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DccP70211 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DccP70211 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DccP70211 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DccP70211 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DccP70211 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DccP70211 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DccP70211 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DccP70211 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DccP70211 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DccP70211 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DccP70211 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DccP70211 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DccP70211 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DccP70211 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DccP70211 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DccP70211 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DccP70211 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DccP70211 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms