Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbdsP70122 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms