Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acta1P68134 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acta1P68134 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms