Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtnP63089 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtnP63089 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtnP63089 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PtnP63089 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtnP63089 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtnP63089 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PtnP63089 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtnP63089 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtnP63089 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtnP63089 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtnP63089 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms