Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp2P63044 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms