Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps3P62908 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps3P62908 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps3P62908 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps3P62908 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps3P62908 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms