Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab3cP62823 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab3cP62823 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms