Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vbp1P61759 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms