Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms