Protein–RNA interactions for Protein: P58355

Slc45a2, Membrane-associated transporter protein, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a2P58355 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc45a2P58355 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a2P58355 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms