Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp25P57080 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp25P57080 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp25P57080 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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