Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc10P56960 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc10P56960 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms