Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sssca1P56873 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms