Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lim2P56563 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lim2P56563 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms