Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd38P56528 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd38P56528 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd38P56528 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd38P56528 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd38P56528 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms