Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFDNP55196 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
AFDNP55196 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AFDNP55196 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.51■■■□□ 2
AFDNP55196 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
AFDNP55196 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFDNP55196 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFDNP55196 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFDNP55196 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFDNP55196 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFDNP55196 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFDNP55196 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFDNP55196 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFDNP55196 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFDNP55196 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFDNP55196 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFDNP55196 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFDNP55196 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFDNP55196 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFDNP55196 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFDNP55196 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFDNP55196 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFDNP55196 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFDNP55196 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFDNP55196 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms