Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Acod1P54987 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acod1P54987 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms