Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms