Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc4P51655 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc4P51655 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc4P51655 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc4P51655 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc4P51655 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc4P51655 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms