Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa8P50706 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa8P50706 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa8P50706 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms