Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Epb42P49222 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Epb42P49222 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb42P49222 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms