Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Edn3P48299 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edn3P48299 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms