Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VdrP48281 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VdrP48281 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VdrP48281 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VdrP48281 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VdrP48281 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VdrP48281 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
VdrP48281 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VdrP48281 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VdrP48281 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VdrP48281 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VdrP48281 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VdrP48281 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VdrP48281 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VdrP48281 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VdrP48281 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VdrP48281 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VdrP48281 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VdrP48281 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VdrP48281 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms