Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl5P47962 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms