Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms