Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtgfrP43117 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtgfrP43117 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms