Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tac1P41539 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tac1P41539 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tac1P41539 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms