Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Etv1P41164 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Etv1P41164 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms