Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl12P35979 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl12P35979 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms