Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab5cP35278 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab5cP35278 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms