Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sftpa1P35242 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sftpa1P35242 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms