Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mep1aP28825 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mep1aP28825 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms