Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dusp1P28563 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dusp1P28563 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dusp1P28563 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dusp1P28563 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dusp1P28563 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dusp1P28563 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp1P28563 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms