Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjb1P28230 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms