Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjc1P28229 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms